De vzw Natuurpunt Beheer - Vereniging voor Natuurbeheer en Landschapszorg in Vlaanderen (afgekort Natuurpunt Beheer) heeft in 2020 een winst van ruim 6 miljoen euro gemaakt. Ook in 2019 was er ruim 6 miljoen euro winst.
De activa stegen naar ruim 336 miljoen euro eind 2020.
Volgens de jaarrekening 2020 werden ruim 17 miljoen euro subsidies ontvangen in dat boekjaar.
Natuurpunt Beheer is de eigenaar en huurder van de natuurgebieden in beheer bij Natuurpunt. Binnen deze specifieke vereniging worden de nodige structuren uitgebouwd om deze natuurgebieden veilig te stellen, in beheer te nemen en verder te ontwikkelen.